ЗАО "Спецсудопроект" было основано 27 декабря 2001 года как проектно-конструкторское бюро, разрабатывающее техническую документацию для судостроительной отрасли.
За годы работы по конструкторской документации ЗАО "Спецсудопроект" судостроительными заводами построено более 65 судов.